A nagy belső tér, az óriási ablakfelületek, valamint az ajtók gyakori nyitása miatt a városi buszok belső terének klimatizálása rendkívül energiaigényes. Mivel a villanymotor nagy hatásfoka miatt üzem közben nem keletkezik hasznosítható hulladékhő, elsősorban a fűtési szezonban fordulhat erő, hogy a teljesen elektromos meghajtású buszok teljes energiafogyasztása majdnem a duplájára nő.
Ez a nagy mértékű plusz energiafogyasztás jelentősen befolyásolja a hatótávolságot. Ezért az eCitaro alaposan átgondolt, intelligens hőgazdálkodása minimálisra csökkenti az energiafogyasztást, és maximális hatótávolságról gondoskodik. A belső tér hőmérséklete már a depóban végzett töltésnél előzetesen a kívánt hőmérsékletre szabályozható. Az utastér hűtése szériatartozéknak számító tetőre szerelt klímaberendezéssel, energiatakarékos hőszivattyú használatával történik.
Az eCitaro utasterének energiatakarékos fűtése egy optimalizált CO2-hőszivattyúval történik, amely most a vízkörre van kötve. Ezáltal csökken a ventilátorral rendelkező, elektromos üzemeltetésű oldalfali fűtőrendszer energiafogyasztása, miközben nő a téli üzem alatti hatótávolság. A szintén ismert frontbox dupla hőcserélővel rendelkezik. Opcionálisan üzemanyaggal működtetett kiegészítő fűtés is használható. Különösen innovatív megoldásnak számít a belső térnek a külső hőmérséklettől függő, automatizált klimatizálása. Ebben az esetben Eco és Komfort jelleggörbék közül választhat. Ez akár 40 százalékkal is növelheti a hatékonyságot.