Aufgrund des großen Innenraums, der riesigen Fensterflächen sowie des häufigen Öffnens der Türen ist die Temperierung des Innenraums eines Stadtbusses sehr energieaufwändig. Da wegen des hohen Wirkungsgrads eines Elektromotors während des Betriebs keine nutzbare Abwärme entsteht, kann sich vor allem in der Heizperiode der Gesamtenergieverbrauch eines vollelektrisch angetriebenen Busses annähernd verdoppeln.
Dieser hohe zusätzliche Energieverbrauch wirkt sich deutlich auf die Reichweite aus. Deshalb minimiert das durchdachte intelligente Thermomanagement des eCitaro den Energieverbrauch und sichert maximale Reichweite. Bereits während der Ladung im Depot kann der Innenraum auf die gewünschte Temperatur vorkonditioniert werden. Die Kühlung des Fahrgastraums erfolgt durch eine serienmäßige Dachklimaanlage mit energiesparender Wärmepumpe.
Der Fahrgastraum des eCitaro wird energiesparend durch eine optimierte CO₂-Wärmepumpe beheizt, die jetzt an den Wasserkreislauf angebunden ist. So sinkt der Energieverbrauch der elektrisch betriebenen Seitenwandheizer mit Gebläse, während die Reichweite im Winterbetrieb steigt. Die ebenfalls bekannte Frontbox verfügt über einen doppelten Wärmetauscher. Optional kann eine kraftstoffbetriebene Zusatzheizung verwendet werden. Besonders innovativ ist die in Abhängigkeit der Außentemperatur automatisierte Temperierung des Innenraums. Hierbei kann zwischen einer Eco- und einer Komfortkennlinie gewählt werden. Dies führt zu einer Effizienzsteigerung von bis zu 40 Prozent.