Λόγω του μεγάλου εσωτερικού χώρου, των τεράστιων επιφανειών των παραθύρων, καθώς και του συχνού ανοίγματος των θυρών, καταναλώνεται πολλή ενέργεια για τον κλιματισμό του εσωτερικού χώρου ενός αστικού λεωφορείου. Επειδή λόγω του υψηλού βαθμού απόδοσης ενός ηλεκτροκινητήρα δεν προκύπτει ωφέλιμη αποβαλλόμενη θερμότητα στη διάρκεια της λειτουργίας, η συνολική κατανάλωση ενέργειας ενός πλήρως ηλεκτροκίνητου λεωφορείου, κυρίως την εποχή που είναι απαραίτητη η θέρμανση, μπορεί σχεδόν να διπλασιαστεί.
Αυτή η επιπλέον κατανάλωση ενέργειας έχει σημαντικό αντίκτυπο στην αυτονομία. Γι’ αυτό, η ειδικά μελετημένη, έξυπνη διαχείριση θερμοκρασίας του eCitaro ελαχιστοποιεί την κατανάλωση ενέργειας και εξασφαλίζει μέγιστη αυτονομία. Ο εσωτερικός χώρος μπορεί να προκλιματίζεται στην επιθυμητή θερμοκρασία κατά τη φόρτιση στο αμαξοστάσιο. Την ψύξη του χώρου επιβατών αναλαμβάνει το σύστημα κλιματισμού οροφής του βασικού εξοπλισμού με αντλία θερμότητας εξοικονόμησης ενέργειας.
Ο χώρος επιβατών του eCitaro θερμαίνεται με χαμηλή κατανάλωση ενέργειας με τη βοήθεια μιας βελτιστοποιημένης αντλίας θερμότητας CO2, που είναι συνδεδεμένη στο κύκλωμα νερού. Έτσι, τα ηλεκτρικά θερμαντικά σώματα με ανεμιστήρα στα πλευρικά τοιχώματα καταναλώνουν λιγότερη ενέργεια, ενώ παράλληλα αυξάνεται η αυτονομία κατά τη χειμερινή λειτουργία. Το επίσης γνωστό κουτί συστήματος κλιματισμού διαθέτει διπλό εναλλάκτη θερμότητας. Προαιρετικά, μπορεί να χρησιμοποιηθεί ένα πρόσθετο σύστημα καλοριφέρ που λειτουργεί με καύσιμο. Ιδιαίτερα πρωτοποριακός είναι ο αυτοματοποιημένος κλιματισμός του εσωτερικού χώρου ανάλογα με την εξωτερική θερμοκρασία. Η δυνατότητα επιλογής μεταξύ δύο χαρακτηριστικών καμπυλών για οικονομική ή άνετη λειτουργία εξασφαλίζει έως και κατά 40 τοις εκατό αυξημένη αποδοτικότητα.