Suuren sisätilan, valtavien ikkunapintojen ja ovien jatkuvan avautumisen takia kaupunkiliikenteen linja-auton matkustamon lämpötilansäätö vaatii paljon energiaa. Sähkömoottorin suuren hyötysuhteen takia hyödynnettävissä olevaa hukkalämpöä ei pääse muodostumaan. Tästä syystä täyssähköisen linja-auton kokonaisenergiankulutus saattaa etenkin lämmityskaudella lähes kaksinkertaistua. Tämä suuri lisäenergian kulutus vaikuttaa selvästi myös toimintamatkaan. Niinpä eCitaroon on suunniteltu älykäs lämpötilanhallintajärjestelmä, joka minimoi energiankulutuksen ja varmistaa maksimaalisen toimintamatkan.
Matkustamo voidaan lämmittää jo valmiiksi haluttuun lämpötilaan varikkolataamisen aikana. Matkustamon jäähdytys tapahtuu vakiovarusteisella kattoilmastointilaitteella energiaa säästävää lämpöpumppua hyödyntäen.
eCitaron matkustamoa lämmitetään energiaa säästäen optimoidulla CO2-lämpöpumpulla, joka on nyt liitetty vesikiertoon. Näin puhaltimilla varustettujen, sähkötoimisten sivuseinälämmittimien energiankulutus laskee samalla kun toimintamatka talvisin kasvaa. Tuttu etulämmityslaite sisältää nyt kaksi lämmönvaihdinta. Lisävarusteena on saatavana polttoainekäyttöinen lisälämmitin. Erityisen innovatiivista on matkustamon lämpötilan säätö automaattisesti ulkolämpötilan mukaan. Valittavissa on tällöin Eco- ja Comfort-säätökäyrästö. Tämä parantaa lämpötilan säädön tehokkuutta jopa 40 prosenttia.