De autobus behoort tot de veiligste vervoersmiddelen ter wereld – ook in het stadsverkeer. Toch kunnen ongevallen niet worden uitgesloten.
Mercedes-Benz heeft er daarom voor gezorgd dat de gevolgen van een ongeval zo veel mogelijk tot een minimum kunnen worden beperkt. De zijwandversteviging draagt bijvoorbeeld in aanzienlijke mate bij aan de passieve veiligheid van de CapaCity.
De passagiers worden ook beschermd door de scheidingswanden, sta- en loopstangen en speciale stoelconfiguratie die de energie absorberen bij een botsing of wanneer de bus over de kop slaat.