De bus behoort tot de veiligste voertuigen – ook in het stadsverkeer. Toch kunnen ongevallen niet worden uitgesloten.
Mercedes-Benz heeft er daarom voor gezorgd dat de gevolgen van een ongeval zo veel mogelijk tot een minimum kunnen worden beperkt. Zo is bijvoorbeeld de zijwandversterking van de eCitaro een belangrijke factor voor zijn grote passieve veiligheid. Bovendien zitten in de eCitaro scheidingswanden, stangen en speciale stoelen, die de energie bij een botsing of over de kop slaan absorberen. Een belangrijke bescherming voor de passagiers.