Autobus należy do najbezpieczniejszych pojazdów – również w komunikacji miejskiej. Mimo tego nie da się oczywiście wykluczyć wypadków.
Mercedes-Benz zadbał o to, by skutki wypadków były możliwie jak najmniej dotkliwe. I tak na przykład istotnym czynnikiem wysokiego poziomu bezpieczeństwa biernego są wzmocnione ściany boczne eCitaro. Ponadto eCitaro posiada ścianki działowe, poręcze i specjalnie skonstruowane siedzenia, które pochłaniają energię podczas zderzenia lub dachowania. To istotna ochrona dla pasażerów.